Pandemi COVID-19 yang berlangsung sejak bulan Maret 2020, membuat manajemen JKT48 menutup JKT48 Theater sementara untuk mencegah penyebaran virus corona.
Selama masa pembatasan sosial berskala besar (PSBB) transisi ini, pelonggaran kembali dilakukan. Sehingga tempat wisata kembali diperbolehkan untuk beroperasi, dengan itu manajemen JKT48 mengumumkan bahwa JKT48 Theater akan kembali beroperasi.
Teater akan beroperasi kembali untuk pertama kali pada Sabtu (31/10/2020) dengan pertunjukan dari Team J setlist “Fajar Sang Idola”. Kemudian pada Minggu (1/11/2020) dibuka untuk pertunjukan Team KIII setlist “Saka Agari”
Tentunya pengoperasian kembali JKT48 Theater ini dengan menerapkan protokol kesehatan yang berlaku. Operasional diperbolehkan dengan kapasitas 25%.
Namun dengan pertimbangan kondisi keamanan, untuk awal-awal ini akan dimulai dengan kapasitas 5% yaitu 20 orang penonton. Sedangkan untuk tiket sementara hanya dapat dibeli oleh anggota Official Fan Club dengan harga Rp 200.000.
Sementara itu untuk proses pembelian tiket dilakukan secara online melalui situs JKT48, dan tidak ada penjualan on the spot. Kemudian tidak ada penukaran tiket dan bingo, karena di tiket otomatis akan ada barcode dan nomor kursi.
Setelah pemeriksaan tiket, dilakukan pengecekan suhu tubuh dan memakai hand sanitizer. Kemudian masuk ke teater dan duduk sesuai nomor kursi. Jika mendapat row pertama, maka akan diberikan face shield oleh staf.
Dengan adanya protokol kesehatan, maka tidak ada hi-touch. Sehingga para penggemar bisa langsung keluar area teater setelah pertunjukan. Untuk streaming pertunjukan teater juga masih dilaksanakan dan tiketnya bisa didapatkan melalui tiket.com.